La CCTA desarrolla y consolida la coordinación interinstitucional a través de sus líneas de acción:

• Gestión Integral de Microcuencas
• Conservación de Cultivos Andinos
• Sistema de Información Tecnológica

Dentro de estas líneas, realiza coordinaciones interinstitucionales; diagnósticos planificación y monitoreo de microcuencas serranas; conservación in situ de cultivos andinos; desarrollo del sistema de información tecnológica (CENITEC y Red CINTEL) y servicios del mismo; así como, ediciones de libros y publicaciones periódicas.